Fonctions refpmsi • refpmsi

Le package refpmsi comprend 2 fonctions : refpmsi() et liste_refpmsi()

`refpmsi()`

refpmsi() charge un référentiel PMSI appelé dans un 1er argument

# récupération du référentiel des ICR
icr <- refpmsi::refpmsi("ccam_icr")
head(icr)

#> # A tibble: 6 x 8
#>   ccam_code ccam_phase ccam_activite ccam_icr_~1 ccam_~2 ccam_~3 ccam_~4 ccam_~5
#>   <chr>     <chr>      <chr>               <int>   <int> <chr>   <chr>   <chr>  
#> 1 AAFA001   0          1                     655     503 1       NA      NA     
#> 2 AAFA002   0          1                     415     232 1       NA      NA     
#> 3 AAFA003   0          1                     762     579 1       NA      NA     
#> 4 AAFA004   0          1                     894     673 1       NA      NA     
#> 5 AAFA005   0          1                     473     260 1       NA      NA     
#> 6 AAFA006   0          1                     427     340 1       NA      NA     
#> # ... with abbreviated variable names 1: ccam_icr_salarie,
#> #   2: ccam_icr_non_salarie, 3: ccam_icr_type, 4: ccam_icr_commentaire,
#> #   5: ccam_code_extension_pmsi

Pour les référentiels annualisés au sens PMSI (CIM-10, GHM, GHS, GME, GMT, OVALIDE, CSARR, …), sélection des années via un 2eme argument.

# exemples avec le référentiel CIM-10 FR à usage PMSI
# sélection d'une année
cim_2019 <- refpmsi::refpmsi("cim",2019)

# sélection de plusieurs années directement
cim_2018_2020 <- refpmsi::refpmsi("cim",2018:2020)

# sélection de plusieurs années via un vecteur
cim_2019_2020 <- refpmsi::refpmsi("cim",c("2019","2020"))

`liste_refpmsi()`

liste_refpmsi() charge la liste des référentiels.

# affichage de la liste documentée des référentiels du package refpmsi::
liste_ref <- refpmsi::liste_refpmsi()
head(liste_ref)

#> # A tibble: 6 x 7
#>   refpmsi                      refpmsi~1 refpm~2 refpm~3 refpm~4 refpm~5 refpm~6
#>   <chr>                        <chr>     <chr>   <chr>   <chr>   <chr>   <chr>  
#> 1 anticancereux_intraghs       Médicame~ ATIH    2020    non     NA      NA      
#> 2 autorisation_mco             Autorisa~ GENRSA  2022    non     NA      NA     
#> 3 autorisation_ssr             Autorisa~ GENRHA  2022    non     NA      NA     
#> 4 cancerologie_appareil_organe Algorith~ INCa (~ 2023    non     Cancér~ https:~~
#> 5 cancerologie_seuil           Algorith~ INCa (~ 2023    non     Cancér~ https:~~
#> 6 ccam_ameli                   Actes CC~ AMELI<~ 2022 (~ oui     NA      NA     
#> # ... with abbreviated variable names 1: refpmsi_lib, 2: refpmsi_source,
#> #   3: refpmsi_periode_version, 4: refpmsi_annualise, 5: refpmsi_article,
#> #   6: refpmsi_article_lien

Pour ne charger que la liste des intitulés des référentiels.

# affichage uniquement des intitulés des référentiels
liste_ref <- refpmsi::liste_refpmsi()$refpmsi
head(liste_ref)

#> [1] "anticancereux_intraghs"       "autorisation_mco"            
#> [3] "autorisation_ssr"             "cancerologie_appareil_organe"
#> [5] "cancerologie_seuil"           "ccam_ameli"