Spécialités pharmaceutiques SMR
Source :vignettes/specialites_pharmaceutiques_ssr.Rmd
specialites_pharmaceutiques_ssr.Rmd
Spécialités pharmaceutiques SMR
Intitulé du référentiel : specialites_pharmaceutiques_smr
Mise à jour : 18 avril 2025
Référentiel des spécialités pharmaceutiques SMR enrichi, par nos soins, avec les libellés des UCD.
Version mars 2025
Variables
ucd_7 = code UCD sur 7 positions
ucd_13 = code UCD sur 13 positions
code_les = code LES (Liste En Sus)
ucd_libelle = libellé de l’UCD
denomination_commune_internationale = dénomination
commune internationale
date_debut = date de début de validité de la spécialité
pharmaceutique SMR
#> Rows: 216
#> Columns: 6
#> $ code_les <chr> "S000013", "S000026", "S000752", "…
#> $ denomination_commune_internationale <chr> "alectinib", "alectinib", "vutrisi…
#> $ ucd_7 <chr> "9426485", "9426485", "9002846", "…
#> $ ucd_13 <chr> "3400894264859", "3400894264859", …
#> $ date_debut <chr> "2023-07-01", "2023-07-01", "2025-…
#> $ ucd_libelle <chr> "ALECENSA 150MG GELULE", "ALECENSA…
Exemples
Soit jeu_specialites_pharmaceutiques_smr
le jeu de
données suivant composé manuellement avec des variables que l’on peut
retrouver dans un FICHCOMP LES SMR
#> # A tibble: 3 × 3
#> nas ucd nb_administre
#> <int> <chr> <int>
#> 1 1 9426485 3
#> 2 2 9289746 2
#> 3 3 9360734 1
Attribution du libellé aux spécialités pharmaceutiques SMR
# library(dplyr)
specialites_pharmaceutiques_smr <- refpmsi::refpmsi(specialites_pharmaceutiques_smr)
jeu_specialites_pharmaceutiques_smr_libelle <- jeu_specialites_pharmaceutiques_smr %>%
dplyr::left_join(specialites_pharmaceutiques_smr %>%
# distinct() car les code_les produisent des doublons par ucd dans le référentiel
dplyr::distinct(ucd_7,ucd_libelle),
join_by(ucd == ucd_7))
jeu_specialites_pharmaceutiques_smr_libelle
#> # A tibble: 3 × 4
#> nas ucd nb_administre ucd_libelle
#> <int> <chr> <int> <chr>
#> 1 1 9426485 3 ALECENSA 150MG GELULE
#> 2 2 9289746 2 BOTOX 50U ALLERGAN PDR INJ
#> 3 3 9360734 1 TEICOPLANINE VIATRIS 200MG PDR INJ
Case mix spécialités pharmaceutiques SMR en DCI
# library(dplyr)
specialites_pharmaceutiques_smr <- refpmsi::refpmsi(specialites_pharmaceutiques_smr)
casemix_specialites_pharmaceutiques_smr_dci <- jeu_specialites_pharmaceutiques_smr %>%
dplyr::left_join(specialites_pharmaceutiques_smr %>%
dplyr::select(ucd_7, denomination_commune_internationale) %>%
# dédoublonnage en faisant l'hypothèse que la DCI d'un UCD ne change pas
dplyr::distinct(),
join_by(ucd == ucd_7)) %>%
# regroupement par DCI
# calcul du nombre de NAS différents avec au moins 1 UCD
# calcul du nombre d'UCD différentes
# calcul du nombre total des administrations des UCD
dplyr::summarise(.by = denomination_commune_internationale,
nb_nas = dplyr::n_distinct(nas),
nb_ucd = dplyr::n_distinct(ucd),
# argument na.rm = TRUE pour gérer les situations où pas de nb_administre
nb_administre = sum(nb_administre, na.rm = TRUE))
casemix_specialites_pharmaceutiques_smr_dci
#> # A tibble: 3 × 4
#> denomination_commune_internationale nb_nas nb_ucd nb_administre
#> <chr> <int> <int> <int>
#> 1 alectinib 1 1 3
#> 2 toxine botulique type A 1 1 2
#> 3 Teicoplanine 1 1 1